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迈安纳学院 / 知识海洋 / NBT-如何在非人灵长类动物(NHPs)中筛选mRNA-LNP
    
 

随着基因治疗和mRNA疫苗的快速发展,LNPs作为核酸药物递送的关键载体,其安全性和有效性评估至关重要。然而,LNPs在不同物种间的递送效率存在显著差异,且传统NHPs实验因伦理和成本限制难以大规模开展。最近James E. Dahlman团队在nature biotechnology发表题为“Lipid nanoparticle screening in nonhuman primates with minimal loss of life”的研究。本研究旨在通过利用终末期NHPs,结合条形码技术,实现LNPs的高通量筛选,以减少动物使用并提高筛选效率。

 
    
   

01
实验结果

   
    
  1.1 LNPs的制备与表征结果  
 

LNPs的制备:成功制备了72种化学组成不同的LNPs,这些LNPs包含了可电离脂质SM-102、胆固醇、三种不同的PEG-脂质以及三种不同的两性离子辅助脂质。通过微流控技术,将每种LNPs与编码aVHH的mRNA及特定的DNA条形码混合,形成了条形码化的LNPs库。

LNPs的表征:使用动态光散射(DLS)技术测量了LNPs的水合直径和多分散性指数(PDI)。结果显示,71种LNPs的PDI低于0.4,表明它们具有良好的单分散性。进一步筛选后,50种LNPs的封装效率高于85%,其中含DOPC的LNPs封装效率相对较低。经过冷冻-解冻循环后,45种LNPs仍保持良好的物理性质,水合直径在50-150 nm之间,PDI低于0.3。

 
    
 

Fig. 1 | Barcoded LNPs can be frozen and thawed.

 
    
  1.2 LNPs在小鼠和NHPs中的递送效率比较  
 

动物实验:将LNPs库静脉注射至C57BL/6J小鼠和终末期NHPs(包括健康对照和胃肠道炎症动物),24小时后收集肝脏、脾脏、骨髓和血液。通过流式细胞术和条形码测序分析,发现与未处理的小鼠相比,注射LNPs的小鼠在13种细胞类型中显示出显著的aVHH表达。在健康对照NHPs中,22种细胞类型中有22种显示出显著的aVHH表达;在胃肠道炎症NHPs中,22种细胞类型中有19种显示出显著的aVHH表达。

递送效率比较:与小鼠相比,NHPs中LNPs的递送效率显著更高。在比较了18种从小鼠和NHPs中分离的细胞类型后,发现NHPs细胞中的aVHH+细胞百分比显著高于小鼠细胞。特别是在肝脏中,NHPs的肝细胞和其他免疫细胞类型中的aVHH表达水平显著高于小鼠。此外,在NHPs的脾脏和骨髓中也观察到了广泛的LNPs递送。

 
    
 

Fig. 2 | Species-dependent LNP delivery.

 
    
  1.3 单细胞多组学分析结果  
 

细胞类型识别与LNPs递送分析发现LNPs不仅递送至肝细胞,还广泛递送至多种免疫细胞类型。在肝脏中,识别出15种细胞类型,其中库普弗细胞的aVHH表达最高;在脾脏中,识别出18种细胞类型,其中巨噬细胞和B细胞表现出较高的aVHH表达;在骨髓中,识别出20种细胞类型,包括多种髓系细胞和造血干细胞/祖细胞。值得注意的是,在CD34+细胞簇中观察到了aVHH阳性细胞,表明LNPs能够转染造血干细胞/祖细胞。

 
    
 

Fig. 3 | Single-cell multiomics readout of functional LNP delivery in NHP

 
    
  1.4 脂蛋白受体与LNPs递送的关系  
 

差异表达基因分析:通过差异表达基因分析,发现多个脂蛋白受体编码基因(如LRP1、LDLRAD3和MSR1)在LNPs递送效率高的细胞中显著上调。这些基因与细胞内吞作用和物质运输相关,提示它们可能在LNPs的体内递送中发挥重要作用。

基因表达与LNPs递送效率的相关性:通过计算LDL复合物评分(基于LRP1、LDLRAD3和MSR1的表达水平),发现细胞中LDL复合物评分与aVHH表达水平呈正相关。这一发现提示,脂蛋白受体可能在LNPs的体内递送中发挥重要作用。

 
    
 

Fig. 4 | LDL receptors are associated with the functional delivery of LNPs across multiple tissues.

 
    
   

02
小结

   
    
 

脂质纳米颗粒(LNPs)作为核酸药物递送的重要载体,在临床前研究中展现出巨大潜力。然而,由于跨物种预测性差及伦理限制,LNPs在非人灵长类动物(NHPs)中的评估面临挑战。本研究通过创建包含条形码的LNPs库,利用终末期NHPs(因自发疾病需安乐死的动物)进行LNPs的高通量筛选,旨在减少动物使用并评估LNPs在NHPs中的递送效率。结果显示,NHPs中LNPs的递送效率显著高于小鼠,且多个脂蛋白受体可能与LNPs的递送相关。本研究为LNPs的优化提供了新的实验模型和数据支持。

 
    
  参考文献:https://doi.org/10.1038/s41587-025-02711-y  
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